O IFHT possui cursos de pós-graduação lato-sensu e stricto-sensu, ambos na modalidade de ensino semipresencial.

A Especilização em Orientação Educacional é voltada para professores da Secretaria de Educação do Estado do Rio de Janeiro e visa habilitá-los como orientadores educacionais. Já o Mestrado Profissional em Gestão Pública é uma qualificação de servidores públicos para a alta gestão.